PCR实验室的空气流向必须严格按照：试剂储存和准备区→标本制备区→扩增区→扩增产物分析区，空气压力逐渐递减方式进行，防止扩增产物顺空气气流进入扩增前的区域。需要严格的通风设计，若通风设计不合理，会使风速流向混乱，甚至危害人们健康；以新冠病毒为例，PCR实验室内会为核酸检测准备4个区域，分别是试剂准备区、样本准备区、扩增区和扩增产物分析区。每个分区各司其职，试剂准备区负责接收患者样本，样本准备区则负责进行对样本的核酸进行提取，扩增区则是扩增复制核酸样本，扩增后分析区就是分析样本内核酸能否与标准样配对，通过仪器检测的到，就判断成阳性，如果检测不到就是阴性。标准的PCR实验室试剂准备区可使用洁净工作台作为试剂配制操作台面，配备加样器、冰箱、天平、低速离心机、混匀器、可移动紫外灯等仪器设备；标准的PCR实验室标本制备区所需的仪器设备主要是生物安全柜。