由于两个标准都参考了美国和欧洲标准, 因而在性能要求方面差异较小。主要包括:垂直下降风速范围JG标准规定是0.25~0.4m/s;YY标准规定是0.25~0.5 m/s, 实际各个厂家在设计产品时都会选择一个最佳的风速值和垂直水平比, 目标都是一样的, 保证安全, 实现三大保护, 所以实质上区别并不大。但是JG标准对于风速的均匀性没有明确规定, 可能造成风速的不均匀, 不能形成较为理想的层流。噪音限值JG标准要求≤65 d B, YY标准要求≤67 d B, 也与NSF49标准一致, 而JG标准更加苛刻一点。光照要求YY标准规定了光照最小的点要≥430 Lux, 国际标准也都有此规定, 从一定程度上避免了工作区内光照的不均匀性, 提高了使用者的舒适度感受, 而JG标准没有规定。温升YY标准规定了机器温升小于8℃, 保证使用者不会不适。另外, YY标准与NSF49标准一样对安全柜的稳定性做了要求, 包括抗倾倒, 柜体抗变形, 抗前倾要求, 保证了安全柜的强度稳定性。JG标准增加了洁净度测试要求, 而YY标准同国外标准一样, 没有此测试, 对于生物安全柜的内部洁净度来说, 主要由过滤器决定, 安全性通过过滤器扫描已完全可以验证。