氨氧化微生物的生长和活性与进水氨氮浓度等营养水平有关，但并不意味着氨氮浓度越高越好。已有研究发现过高浓度的氨氮将会抑制AOA中氨单加氧酶的活性⋯]。Mattens—Habbena等[42]对第一株分离到的AOA的研究表明AOA倾向于(极)低氨氮浓度．并且对氨氮具有比AOB更高的亲和性。有研究发现在低氮源浓度的环境中AOA数量远远高于AOB．处于主导地位[43]。由此可见，寡营养环境的饮用水系统中，AOA应给与足够的重视。此外．有机质的种类和含量也可以影响水中氨氧化微生物的生长和活性m]．如通过改变异养细菌的丰度从而问接抑制氨氧化细菌的生长代谢。