二氧化碳培养箱应由专人负责使用，操作盘上的任何开关和调节旋扭一旦固定后，不要随意扭动，以免影响箱内温度，二氧化碳浓度，湿度的波动，同时降低机器的灵敏度。箱子的放置要水平，避免阳光直射和灰尘等，要保证仪器周围的气流循环，后部及侧面应留出5 cm的空隙。加装稳压电源保证电源电压波动不超过 220 V±10％。所加入的水必须是蒸馏水或无离子水，防止矿物质储积在水箱内产生腐蚀作用，经常检查箱内水是否足够，水位应加至 “水位指示灯”灭灯时为止。使用前箱内应用消毒酒精或碘溶液彻底擦洗，防止其他微生物污染，导致实验失败。在房间安装空调，使环境温度保持在 25~C左右。所使用的二氧化碳必须是纯净的，否则降低二氧化碳传感器的灵敏度和污染二氧化碳过滤装置。